L'institut accueille des membres répartis en une section d'études égyptologiques et papyrologiques et une section d'études coptes et arabo-islamiques. Il peut admettre des membres à titre étranger.
Il accueille également des boursiers et reçoit, pour des missions temporaires, des chercheurs et des enseignants.
Le directeur de l'institut peut inviter des personnalités susceptibles de conseiller ses membres, de participer aux programmes scientifiques, aux fouilles, aux colloques et aux séminaires qu'il organise. Les conditions d'accueil de ces personnalités sont fixées par le règlement intérieur de l'institut.