La durée du mandat des membres du conseil d'administration, du conseil scientifique, du conseil des études et du conseil de perfectionnement est de quatre ans à compter de la date d'installation de ceux-ci, à l'exception de celle des représentants des élèves, qui est d'un an. Le mandat des membres du conseil d'administration est renouvelable une fois. Le mandat des membres des autres conseils est renouvelable sans limitation.Tout mandat exercé pendant une durée supérieure à dix-huit mois vaut mandat plein pour l'exercice de cette clause de renouvellement.
Le ministre chargé de la mer peut proroger le mandat des membres du conseil d'administration, sur proposition de son président, pour une durée maximale d'un an.