Avis n°2026.0011/AC/SEAP du 22 janvier 2026 du collège de la Haute Autorité de santé relatif à l’inscription sur la liste des actes et prestations mentionnée à l’article L. 162-1-7 du code de la sécurité sociale, des techniques d’amplification des acides nucléiques (TAAN) multiplex dans la prise en charge médicale des infections des voies respiratoires supérieures
Le collège de la Haute Autorité de santé ayant valablement délibéré en sa séance du 22 janvier 2026,
Vu le code de la sécurité sociale, notamment son article L. 162-1-7 ;
Vu la liste des actes et prestations adoptée par la décision de l’Union nationale des caisses d’assurance maladie du 11 mars 2005, modifiée ;
Vu la liste des actes et prestations pour la partie relative aux actes de biologie médicale, telle qu’elle a été définie par la décision de l’Union nationale des caisses d’assurance maladie du 4 mai 2006, modifiée ;
Vu la saisine pluriannuelle de la Direction générale de l’offre de soins (DGOS) du 27 octobre 2021 ;

Vu le rapport d’évaluation technologique intitulé « Intérêt des techniques d’amplification des acides nucléiques (TAAN) multiplex dans la prise en charge médicale des infections des voies respiratoires supérieures » adopté par la décision n°2026.0013/DC/SEAP du 22 janvier 2026 du collège de la Haute Autorité de santé ;
ADOPTE L’AVIS SUIVANT :
Le présent avis repose sur l’ensemble des éléments recueillis et analysés dans le rapport d’évaluation technologique susvisé, à savoir :
‒ les conclusions de l’analyse critique de la littérature synthétique disponible ;
‒ les points de vue des experts et positions des parties prenantes sollicitées.
Ainsi, considérant notamment :
‒ la convergence de recommandations nationales et internationales privilégiant une approche diagnostique privilégiant l’évaluation clinique parfois complétée par des tests biologiques (TDR/TROD, cultures) ;
‒ l’absence fréquente, dans ces recommandations, de proposition de recours explicite aux techniques d’amplifications des acides nucléiques (TAAN) multiplex ;
‒ l’accord global des experts et des parties prenantes avec ces recommandations,
la Haute Autorité de santé (HAS) est défavorable à l’inscription sur la liste des actes et prestations, mentionnée à l’article L. 162-1-7 du code de la sécurité sociale, de l’acte d’amplification des acides nucléiques (TAAN) multiplex dans les indications suivantes :
‒ rhinopharyngite aiguë [Service attendu (SA) insuffisant] ;
‒ amygdalite aiguë [SA insuffisant] ;
‒ rhinosinusite aiguë [SA insuffisant] ;
‒ otite moyenne aiguë [SA insuffisant] ;
‒ infections aiguës du larynx :
− laryngite aiguë [SA insuffisant] ;
− laryngite sous-glottique [SA insuffisant] ;
− épiglottite aiguë [SA insuffisant].
Par ailleurs, en présence d’un syndrome pseudo-grippal, considérant les éléments suivants :
– la co-circulation en période épidémique hivernale, de plusieurs virus respiratoires majeurs (virus influenza A, influenza B, virus respiratoire syncytial (VRS) et SARS-CoV-2), responsables de tableaux cliniques similaires,
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compliquant le diagnostic différentiel et contribuant à des pics d’activité concomitants et à une surcharge des structures hospitalières ;
– de l’existence de recommandations en faveur d’un traitement antiviral précoce chez les patients à risque, avec un bénéfice démontré en milieu hospitalier en cas de syndrome pseudo-grippal ;
– du risque élevé de formes graves et de complications chez des populations vulnérables, en particulier les personnes immunodéprimées, âgées, enceintes, atteintes de pathologies chroniques ou vivant en collectivité ;
– de l’insuffisance et de l’incertitude des données disponibles en médecine de ville, ne permettant pas de conclure de manière robuste sur l’intérêt clinique de ces tests en ambulatoire ;
– de la perspective d’une mise à jour future des recommandations concernant l’utilisation des tests rapides d’orientation diagnostique en médecine de ville, ceux-ci pouvant jouer un rôle à condition que des données probantes viennent étayer leur intérêt clinique ;
la Haute Autorité de santé (HAS) est :
– favorable à l’inscription sur la liste des actes et prestations mentionnée à l’article L. 162-1-7 du code de la sécurité sociale, des techniques d’amplification des acides nucléiques quadriplex (virus influenza A, influenza B, VRS et SARS-CoV-2) dans la prise en charge médicale des infections des voies respiratoires supérieures, en présence d’un syndrome pseudo-grippal (patients symptomatiques) en période épidémique, lorsque la réalisation du test et la rapidité de restitution des résultats sont susceptibles d’avoir un impact immédiat sur la prise en charge médicale notamment par la prescription d’un traitement antiviral dans le respect des conditions en vigueur pour le traitement considéré, par l’arrêt d’un traitement antibiotique, ou encore par la mise en œuvre de mesures de rupture de la chaîne de transmission et d’isolement du patient, lorsque ces mesures sont réalisables et cohérentes avec les capacités organisationnelles réelles du service, dans les situations suivantes :
− patients à l’hôpital (urgences ou hospitalisation) [SA suffisant et Amélioration du Service Attendu (ASA) de niveau III] ;
− patients résidents en établissements ou services sociaux et médico-sociaux (EHPAD…) dont l’état ne nécessite pas un transfert à l’hôpital [SA suffisant et ASA de niveau III] ;
– défavorable à l’inscription :
− d’autres TAAN multiplex dans les deux situations susmentionnées [SA insuffisant] ;
− des TAAN multiplex en soins de ville ambulatoire [SA insuffisant].
Conditions de réalisation
Le prélèvement nasopharyngé est réalisé en première intention. A défaut, les prélèvements oropharyngé ou par expectoration peuvent être envisagés.
La HAS rappelle l’importance de bien connaître les limites des TAAN multiplex afin d’utiliser ces dernières de manière optimale :
‒ les TAAN multiplex doivent être effectuées après examen clinique systématique du patient, comme tout test diagnostic paraclinique ;
‒ les TAAN multiplex ont des performances diagnostiques intrinsèquement liées à la qualité du prélèvement et en fonction de la fenêtre de détection des acides nucléiques spécifique des agents concernés. Un prélèvement réalisé en dehors des conditions optimales peut altérer la sensibilité analytique, augmentant ainsi le risque de faux-négatifs et compromettant l’interprétation clinique des résultats ;
‒ les performances de la détection de chaque agent du panel devront tendre vers une sensibilité minimale de 90 % et une spécificité minimale de 95 %. Si pour des raisons techniques les performances diagnostiques requises ne sont pas atteignables pour un agent, celles-ci devront au moins être égales à celles de la TAAN simplex correspondante, dans la mesure où celles-ci sont cliniquement satisfaisantes. Dans ce cas de figure, il appartient au biologiste de reconfirmer le résultat par le test conventionnellement utilisé ;
‒ les TAAN sont limitées à la détection des agents inclus dans chaque panel spécifique. Il est crucial de reconnaître les limites intrinsèques des kits utilisés. En l’état actuel de l’offre technologique, ces systèmes ne permettent pas une identification exhaustive de toutes les étiologies possibles et peuvent présenter des « zones d’ombre » diagnostiques, notamment pour certains pathogènes rares. Ces limitations doivent être intégrées dans le raisonnement décisionnel, afin d’orienter judicieusement la prise en charge ;
‒ les TAAN ne peuvent se substituer intégralement aux techniques de microbiologie conventionnellement recommandées pour une prise en charge optimale ;
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‒ leurs résultats doivent être rendus dans un délai compatible avec la prise en charge médicale optimale du patient.
Le présent avis sera publié au Bulletin officiel de la Haute Autorité de santé.
Fait le 22 janvier 2026.
Pour le collège : Le président de la Haute Autorité de santé, P^R LIONEL COLLET Signé

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