Avis n°2026.0035/AC/SEAP du 11 juin 2026 du collège de la Haute Autorité de santé relatif à l’inscription sur la liste des actes et prestations mentionnée à l’article L. 162-1-7 du code de la sécurité sociale, des actes d’amplification des acides nucléiques (TAAN) dans la prise en charge des personnes de retour de voyage en zone endémique
Le collège de la Haute Autorité de santé ayant valablement délibéré en sa séance du 11 juin 2026,
Vu le code de la sécurité sociale, notamment son article L. 162-1-7 ;

Vu la liste des actes et prestations adoptée par la décision de l’Union nationale des caisses d’assurance maladie du 11 mars 2005, modifiée ;

Vu la liste des actes et prestations pour la partie relative aux actes de biologie médicale, telle qu’elle a été définie par la décision de l’Union nationale des caisses d’assurance maladie du 4 mai 2006, modifiée ;

Vu la saisine pluriannuelle de la Direction générale de l’offre de soins (DGOS) du 27 octobre 2021 ;

Vu le rapport d’évaluation technologique intitulé « Intérêt des techniques d’amplifications des acides nucléiques (TAAN) dans la prise en charge des personnes de retour de voyage en zone endémique » adopté par la décision n°2026.0100/DC/SEAP du 11 juin 2026 du collège de la Haute Autorité de santé ;

Vu l’avis du 22 juin 2011 du collège de la Haute Autorité de santé relatif à la PCR en temps réel pour la détection de l’ADN des leptospires ;

Vu le rapport d’évaluation validé par la décision n°2013.0005/DC/SEAP du 30 janvier 2013, relatif au diagnostic biologique direct précoce de la dengue par détection génomique du virus avec RT-PCR ;

Vu le rapport d’évaluation validé par la décision n°2013.0006/DC/SEAP du 30 janvier 2013, relatif au diagnostic biologique direct précoce du chikungunya par détection génomique du virus avec RT-PCR ;

Vu l’avis n°2016.0022/AC/SEAP du 2 mars 2016 du collège de la Haute Autorité de santé relatif à la modification de la Liste des actes et prestations mentionnée à l’article L. 162-1-7 du code de la sécurité sociale, relatif à la détection du virus Zika dans le sang et les urines par transcription inverse – amplification génique par polymérisation en chaîne ;

Vu l’avis n°2017.0072/AC/SEAP du 19 juillet 2017 relatif à la modification de la liste des actes et prestations mentionnée à l’article L. 162-1-7 du code de la sécurité sociale portant sur l’actualisation des actes de biologie médicale relatifs au diagnostic de la leishmaniose ;

Vu l’avis n°2019.0032/AC/SEAP du 29 mai 2019 du collège de la Haute Autorité de santé relatif à l’inscription sur la liste des actes et prestations mentionnée à l’article L. 162-1-7 du code de la sécurité sociale d’un test d’amplification des acides nucléiques pour le diagnostic biologique de l’infection par le virus du Nil occidental ;

Vu l’avis n°2024.0067/AC/SEAP du 14 novembre 2024 du collège de la Haute Autorité de santé relatif à l’inscription sur la LAP mentionnée à l’article L. 162-1-7 du CSS, de l’acte d’amplification des acides nucléiques (TAAN) multiplex dans la prise en charge médicale des infections gastro-intestinales ;

Vu l’avis n°2024.0073/AC/SEAP du 12 décembre 2024 du collège de la Haute Autorité de santé relatif à l’inscription sur la liste des actes et prestations mentionnée à l’article L. 162-1-7 du code de la sécurité sociale, de l’acte d’amplification des acides nucléiques (TAAN) multiplex dans la prise en charge médicale des infections respiratoires basses ;

ADOPTE L’AVIS SUIVANT :

Considérant :

‒ les conclusions de l’analyse critique de la littérature synthétique disponible et les points de vue des experts et positions des parties prenantes sollicitées ;

‒ que ces éléments ont permis de montrer pour les techniques d’amplifications des acides nucléiques (TAAN) :

– de meilleures performances diagnostiques pour la détection des agents infectieux comparativement aux méthodes traditionnelles,
5 avenue du Stade de France – F 93218 Saint-Denis La Plaine CEDEX – Tél. : +33(0) 1 55 93 70 00 www.has-sante.fr - N° SIRET : 110 000 445 00020 – code APE : 8411 Z

---

– un impact organisationnel favorable eu égard au gain de temps apporté par la technique,
– une amélioration de la prise en charge des patients ; la Haute Autorité de santé (HAS) donne un avis favorable à l’inscription sur la liste des actes et prestations, mentionnée à l’article L. 162-1-7 du code de la sécurité sociale, des actes d’amplification des acides nucléiques (TAAN) simplex ou multiplex réalisé chez des personnes de retour de voyage en zone endémique dans les situations cliniques et conditions suivantes :

Diarrhée de retour de voyage en zone d’endémie : Le recours à la TAAN multiplex (panels bactérien et/ou parasitaire) est indiqué selon les modalités et la composition (cf. annexe, figure 1) définies dans l’avis du collège susvisé relatif aux TAAN multiplex dans la prise en charge médicale des infections gastro-intestinales [Service Rendu (SR) suffisant] ;

Dans le cadre d’un recours à la TAAN multiplex en cas de suspicion de diarrhée infectieuse de retour de voyage en zone endémique, la HAS rappelle :

‒ la nécessité pour le prescripteur de donner l’information relative au voyage en zone endémique au laboratoire (destination, date) ;

‒ la nécessité de conservation des méthodes traditionnelles : en cas de TAAN positive avec le panel bactérien, la culture bactérienne reste indispensable pour l’identification précise de l’espèce bactérienne ± le sérogroupe ou sérotype et pour l’obtention de l’antibiogramme. En cas de test PCR positif, la culture doit être réalisée sans délai. En cas de diarrhée persistante après une première TAAN multiplex négative, le recours à une approche conventionnelle par culture doit être privilégiée.

Symptômes respiratoires au retour de voyage en zone endémique :
– En cas de suspicion de pneumopathies fréquentes , la HAS rappelle qu’il n’y pas de spécificité particulière en matière de prise en charge des patients qu’ils soient de retour de voyage ou non. Ainsi, le recours aux TAAN multiplex est indiqué selon les modalités (indications et compositions) définies dans l’avis susvisé de la HAS portant sur les TAAN multiplex dans la prise en charge médicale des infections respiratoires basses [SR suffisant]. La HAS souligne la nécessité de se renseigner sur les épidémies en cours dans la zone de voyage si le patient présente des symptômes respiratoires au retour de voyage.

– En cas de forte suspicion de tuberculose , le recours à la TAAN simplex tuberculose est indiqué [Service
Attendu (SA) suffisant et Amélioration du Service Attendu (ASA) de niveau III] uniquement :

– dans le cadre d’un voyage prolongé, au sein d’une population locale, dans un pays à forte incidence ;

– pour des populations vulnérables.

Dans ce contexte spécifique, la HAS souligne :

– la nécessité d’évaluer à l’interrogatoire les risques liés au voyage et de préciser la nature/durée du voyage, le délai entre survenue des symptômes et le retour de voyage, ainsi que le type de population concernée, afin de pouvoir poser l’indication de recours à la TAAN ;

– un recours non systématique à la TAAN simplex tuberculose et en complément des techniques de diagnostic usuel.

Dermatoses au retour de voyage en zone endémique : suspicion de leishmanioses La recherche d’ADN Leishmania par amplification génique (PCR) est indiquée, selon les modalités définies dans l’avis du collège de la HAS susvisé relatif au diagnostic de la leishmaniose, devant toute suspicion de leishmanioses (cutanée, cutanéomuqueuse et viscérale) afin de poser le diagnostic [SR suffisant]. La HAS rappelle que cette recherche s’effectue sur prélèvement sanguin ou de moelle osseuse pour les cas de suspicion de forme viscérale et sur prélèvement de lésions des formes cutanées ou cutanéomuqueuses (biopsie, ponction, grattage, écouvillonnage…). Le résultat est quantitatif sur prélèvement sanguin et qualitatif pour tous les autres prélèvements.
Fièvre au retour de voyage en zone endémique :
– En cas de suspicion de paludisme, la stratégie diagnostique recommandée est la suivante :

– la TAAN simplex rapide (Plasmodium falciparum) est indiquée en première ligne [SA suffisant et ASA de niveau III], au même titre que les tests par goutte épaisse ou frottis/goutte épaisse. Lorsque ces techniques ne sont pas réalisables, l’association frottis sanguin/test de diagnostic rapide antigénique immunochromatographique (TDR) peut être réalisée en première ligne ;

Avis n°2026.0035/AC/SEAP du 11 juin 2026 Page 2 / 5

---

– observation sur frottis et détermination de la parasitémie ;

– confirmation ou détermination de l’espèce ensuite réalisée par frottis/goutte épaisse ou TAAN multiplex plasmodiale [SA suffisant et ASA de niveau III].

La HAS souligne que :

– le recours à la TAAN simplex rapide (Plasmodium falciparum) en première ligne n’est pas préconisé en substitution des autres techniques de première ligne disponibles pour le diagnostic biologique du paludisme ;

– le choix de la modalité diagnostique de première intention à privilégier pour la recherche étiologique a été laissé aux laboratoires.

– En cas de suspicion d’infection par les virus de la dengue du chikungunya ou Zika , le recours à la TAAN multiplex « dengue, chikungunya, Zika » ou à défaut aux TAAN simplex correspondantes est indiqué en première ligne selon les modalités définies dans les rapports et avis du collège de la HAS susvisés correspondant [SR suffisant].

– En cas de suspicion d’infection par le virus du Nile occidental , le recours à la TAAN simplex est indiqué selon les modalités définies dans l’avis du collège susvisé relatif à la TAAN pour le diagnostic biologique l’infection par le virus du Nil occidental [SR suffisant].

– En cas de suspicion d’infection au virus à Oropouche , le recours à la TAAN simplex est indiqué [SA suffisant et ASA de niveau III] sur prélèvement sanguin EDTA, en première ligne chez un patient symptomatique, jusqu’au 7ème jour suivant le début des symptômes et/ou par sérologie à partir du 5ème jour.

– En cas de suspicion d’infection par le virus de la fièvre jaune , le recours à la TAAN simplex est indiqué lors du diagnostic étiologique, en prenant notamment préalablement en considération le lieu du voyage, l’épidémiologie et l’émergence régionale du virus (Afrique, Amériques) [SA suffisant et ASA de niveau III].

– En cas de suspicion d’infection par le virus de l’encéphalite à tiques , le recours à la TAAN simplex est indiqué lors du diagnostic étiologique, en prenant notamment préalablement en considération le lieu du voyage, l’épidémiologie et l’émergence régionale du virus (Europe centrale et Eurasie) [SA suffisant et ASA de niveau III].

– En cas de suspicion d’infection par le virus Toscana , le recours à la TAAN simplex est indiqué lors du diagnostic étiologique, en prenant notamment préalablement en considération le lieu du voyage, l’épidémiologie et l’émergence régionale du virus (pourtour méditerranéen) [SA suffisant et ASA de niveau III].

– En cas de suspicion de leptospirose , l’utilisation de la TAAN simplex est indiquée selon les modalités définies dans l’avis du collège de la HAS susvisé relatif au diagnostic de la leptospirose [SR suffisant].

La HAS rappelle que cette TAAN est réalisée sur prélèvement sanguin, avant toute antibiothérapie, uniquement en phase virémique (dans les dix premiers jours après le début de la maladie).

L’algorithme décisionnel récapitulant la prise en charge par TAAN de la personne de retour de voyage en zone endémique est présenté dans la figure 2, en annexe du présent avis.

Le présent avis sera publié au Bulletin officiel de la Haute Autorité de santé.

Fait le 11 juin 2026.

Pour le collège : Le président de la Haute Autorité de santé, P^R LIONEL COLLET Signé
Avis n°2026.0035/AC/SEAP du 11 juin 2026 Page 3 / 5

---

Annexe à l’avis n°2026.0035/AC/SEAP du 11 juin 2026 du collège de la Haute Autorité de santé relatif à l’inscription sur la liste des actes et prestations mentionnée à l’article L. 162-1-7 du code de la sécurité sociale, de l’acte d’amplification des acides nucléiques (TAAN) dans la prise en charge des personnes de retour de voyage en zone endémique
Figure 1. Composition des panels bactérien et parasitaire de la TAAN multiplex à utiliser en cas de suspicion de diarrhée de retour de voyage en zone endémique.
Avis n°2026.0035/AC/SEAP du 11 juin 2026 Page 4 / 5

---

Figure 2. Algorithme décisionnel de prise en charge par TAAN de la personne de retour de voyage en zone endémique.
(1) Composition des panels bactérien et parasitaire de première et seconde intention de la TAAN multiplex à utiliser en cas de suspicion de diarrhée infectieuse de retour de voyage en zone endémique. (2) Uniquement dans certaines indications : i) voyage prolongé au sein d’une population locale dans un pays à forte incidence ii) populations vulnérables. (3) Les PCR simplex pour la recherche étiologique de Leischmania, Leptospira, de la dengue, du chikungunya, du Zika et du virus du Nil occidental, ainsi que la RT-PCR multiplex « dengue, chikungunya, Zika », ont déjà été inscrites à la nomenclature des actes de biologie médicale. (4) Autres arbovirus : virus de l’encéphalite japonaise, virus de la fièvre de la vallée du Rift, virus de la fièvre jaune, virus de l’encéphalite à tiques, virus Toscana, virus à Oropouche. Cas particulier non représenté : symptômes respiratoires au retour de voyage.

Avis n°2026.0035/AC/SEAP du 11 juin 2026 Page 5 / 5